1991年夺得了进入联盟以的第一个分区冠军，但伴随着球队经理芬克斯因为肺癌去世，球队再次滑入了深渊。
从1993年开始到2006年，他们仅仅只在2000年进入过一次季后赛。
2005年，新奥尔良遭遇了卡特里娜飓风，整座城市满目疮痍，不仅摧毁了无数人的生活，同时也摧毁了圣徒队的崛起希望，甚至因为球场遭到了严重破坏，他们不得不辗转不同的球场举办主场比赛，流离失所。
从不曾真正站在巅峰的圣徒队，却始终在流浪、始终在挣扎、始终在饱受痛苦折磨。
2006年，再次到了新奥尔良扎根的圣徒队，赢得了这座城市的尊重，即使再最危难的时候，球队也不曾放弃、不曾离开，现在，这座城市需要他们重新，唤醒人们的希望，在灾难之后开启漫长的重建工作。
这一年，成为了圣徒队第二个辉煌年代的开启。
前任达拉斯牛仔的助理教练肖恩佩顿（seanpayton）走马上任，并且在佩顿的坚持下，他们在自由市场之上做出了球队历史上最大的赌博
签下了圣迭戈闪电的四分卫德鲁布里斯。
当时，布里斯饱受肩伤困扰，并没有能够完全从手术之中恢复过，闪电队没有开出高价续约合同，于是布里斯进入自由市场，圣徒队以六年六千万的合同完成了这笔大胆而冒险的交易；同年，他们还在选秀大会之上完成了至少三个重要的关键选秀，构建了球队基石。
2006年、2009年、2010年，圣徒队先后三次杀入季后赛，其中2009年更是夺得了球队历史上的第一座也是唯一一座超
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