1902年1月4日，法国人终于在巨大困难面前退却了，在征得公司董事会同意后，莫理斯·博电告米国政府，愿以4000万美元的价格转让其财产和租让权。
1月28日，米国国会授权西奥多·罗斯福总统完成对法国运河公司的收购，但转让还须得到哥伦比亚政府的同意才能生效。
但是米国政府在取得哥伦比亚政府同意一事上，遇到了哥伦比亚议会和社会舆论的巨大阻碍，几经反复，迟迟不能定案。
米国人这时候意识到；
在巴拿马运河修筑问题上，彻底排除哥伦比亚议会的干扰，只有让巴拿马独立才能够做到，于是紧锣密鼓的策划起来。
1903年6月14日，米国《纽约世界报》发表文章，鼓吹如果哥伦比亚政府一意孤行，仍然为米国收购法国运河公司的租让权设立障碍，则巴拿马人民为捍卫自身利益，应该脱离哥伦比亚而独立。
7月，巴拿马“爱国者小组”开始讨论独立起义的具体计划。
8月，阿马多到纽约会见了克伦威尔和瓦里亚，得到了米国政府将会支持独立起义的消息，瓦里亚表示，他已得到西奥多·罗斯总统和米尔顿·海约翰国务卿的明确承诺，米国政府将承认巴拿马独立并保护革命者。
1903年11月4日，巴拿马举行群众集会，宣布独立，推选阿马多为共和国首任总统。
阿马多在会上致辞时高呼：“巴拿马共和国万岁！罗斯福万岁！米国万岁！”的口号，这已经很能说明问题。
对于巴拿马的独立，一位米国参议员写道：
巴拿马人民是站起来了，像11
第939章新增领土问题(6/8)