诺亚想要发动灭世大海啸收割最后一批源能返回迈因特宇宙治愈迈因特公主的时候，终焉选择站到了人类的这一边。
终焉的背叛来得非常突然，毫不知情的诺亚被打了一个措手不及，甚至没来得及让诺雅公主动用指挥模块的权限。
悬浮在地球上空的中星号在诺亚与终焉的权限斗争之中一分为二，分别落到了地球的南北两极，成为了如今的天渊殿与归墟宫。
中星号的指挥模块也正是在中星号分离的过程中散落到了世界屋脊的最高峰，霍拉斯加之冠的巅峰之上。
中星号的控制权限从此一分为三，两位主宰各执掌百分之四十七点五，指挥模块拥有百分之五，但除了造物主，诺亚和终焉都没有使用指挥模块的权限。
而想要动用中星号的力量，就必须至少具备百分之五十一的权限，所以两位主宰能动用的就只剩下了控制源能的权限。
可在权限相同的情况下，两位主宰是不可能分出胜负的，因此，另一种博弈开始了。
在大海啸结束之后，漆黑的深海恶魔带着毁灭一切智慧生命的怨恨从深海之中涌出，登上陆地，灭杀一切智慧生命，朝着世界屋脊而去。
在世界大战与大海啸之后残存的人类再次遭受到了重大的打击，万幸的是，在神圣布里赛尔的城墙之下，人类耗干最后的一滴血之前，与深海有着惊人相似性的舰娘出现了。
深海与舰娘，海洋与陆地，迈因特文明与人类文明，两种兵器，两位主宰，两个文明，甚至两个宇宙，开始了一场赌上一切的博弈！